Oddíl byl založen pod názvem DFC Compex Otrokovice na podzim 1991. U zrodu stál spolumajitel firmy Compex Otrokovice pan Ing. Ladislav Kvapil, který doposud působí v klubu jako sekretář ženského fotbalu. První mistrovské utkání týmu bylo odehráno ve II. lize dne 6.9.1992. V prvním roce obsadil tým žen 4. místo. V ročníku 1993-1994 pak přišel postup do I ligy, když v soutěži Compex neztratil ani bod a zvítězil s celkovým skóre 95:1. Od ročníku 1994-1995 hraje tým I. Celostátní ligu žen v České republice bez přestávky. Od ročníku 2006-2007 ženský tým přestoupil pod hlavičku 1. FC Slovácko, a.s., kde se postupně kromě „A“ týmu vytvářely také mládežnické dívčí celky (U19, U15, U13, U11). Začala fungovat spolupráce a propojenost mezi dívčím fotbalem a školami.
…služebně NEJstarší hráčkou 1.FC Slovácko je Katarína Strožová (nar. 13. 2. 1986). Od sezóny 2004/2005 hrála ještě za tehdejší DFC Compex Otrokovice, poté již pod hlavičkou 1. FC Slovácko. Letošní sezóna je pro ni již 15. sezónou v našem dresu. Dohromady nastoupila v dresu Slovácka k více než 300 zápasům.
…NEJvětší hvězdou historie je Iveta Dudová (dnes Chmelová), která hrála v letech 1993-2003. Odehrála 206 utkání, ve kterých nastřílela 241 branek. V roce 1999 byla vyhlášena nejlepší fotbalistkou ČR. V letech 1998-2002 se stala nejlepší střelkyní 1. ligy. Držitelka rekordu 45 branek za sezónu.
…NEJvětší přestup Dagmar Urbancová v roce 2003 do prvoligového Bayernu Mnichov, kde se stala pilířkou základní sestavy.
SOUČASNÉ REPREZENTANTKY
ČR Ženy A – Růžičková Barbora, Klímová Markéta, Janků Kristýna, Janíková Eliška
ČR U19 – Krejčířová Nela, Siváková Kristýna, Malatová Aneta, Krištofová Šárka, Valášková Natálie, Illéšová Sára, Šperová Kateřina, Pěčková Alena, Suchánková Viktorie
Slovensko U19 – Bieliková Laura, Bátkyová Karolína
ČR U17 – Fojtíková Nikola, Jelínková Lucie, Ohlídalová Terezie, Furiková Kateřina, Holá Andrea, Polášková Aneta, Žufánková Jana
Umístění v jednotlivých ročnících I. ligy:
94-95 6.místo
95-96 5.místo
96-97 7.místo
97-97 5.místo
98-99 3.místo
99-00 3.místo
00-01 2.místo
01-02 2.místo
02-03 4.místo
03-04 4.místo
04-05 3.místo
05-06 3.místo
06-07 3.místo (1.FCS)
07-08 3.místo (1.FCS)
08-09 3.místo (1.FCS)
10-11 3.místo (1.FCS)
10-11 3.místo (1.FCS)
11-12 3.místo (1.FCS)
12-13 5.místo (1.FCS)
13-14 4.místo (1.FCS)
14-15 3.místo (1.FCS)
15-16 3.místo (1.FCS)
16-17 3.místo (1.FCS)
17-18 3.místo (1.FCS)